Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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