Protein–RNA interactions for Protein: P62242

Rps8, 40S ribosomal protein S8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps8P62242 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps8P62242 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps8P62242 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps8P62242 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps8P62242 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps8P62242 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps8P62242 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps8P62242 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps8P62242 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps8P62242 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps8P62242 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps8P62242 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps8P62242 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps8P62242 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps8P62242 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps8P62242 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms