Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrch1P62046 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrch1P62046 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch1P62046 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms