Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga11P61622 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga11P61622 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga11P61622 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga11P61622 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga11P61622 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga11P61622 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga11P61622 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms