Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abce1P61222 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abce1P61222 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abce1P61222 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abce1P61222 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abce1P61222 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abce1P61222 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Abce1P61222 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms