Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf13P61216 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf13P61216 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf13P61216 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms