Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps5P59438 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps5P59438 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps5P59438 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps5P59438 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps5P59438 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps5P59438 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms