Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps33bP59016 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps33bP59016 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps33bP59016 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms