Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhbdl3P58873 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhbdl3P58873 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms