Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P58686 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P58686 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P58686 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P58686 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P58686 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P58686 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P58686 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P58686 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P58686 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P58686 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P58686 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P58686 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P58686 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P58686 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P58686 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P58686 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P58686 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P58686 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P58686 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P58686 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P58686 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P58686 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P58686 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P58686 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P58686 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P58686 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P58686 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P58686 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P58686 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P58686 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P58686 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P58686 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P58686 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P58686 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P58686 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P58686 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P58686 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P58686 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P58686 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P58686 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P58686 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P58686 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P58686 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P58686 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P58686 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P58686 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P58686 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P58686 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P58686 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P58686 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P58686 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P58686 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P58686 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms