Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NcstnP57716 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NcstnP57716 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NcstnP57716 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NcstnP57716 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NcstnP57716 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NcstnP57716 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NcstnP57716 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NcstnP57716 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NcstnP57716 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NcstnP57716 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NcstnP57716 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NcstnP57716 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms