Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gsc2P56916 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms