Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sssca1P56873 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sssca1P56873 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms