Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pdcd5P56812 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd5P56812 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd5P56812 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd5P56812 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd5P56812 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms