Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd38P56528 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd38P56528 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd38P56528 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd38P56528 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd38P56528 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms