Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf5P56477 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf5P56477 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf5P56477 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf5P56477 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf5P56477 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf5P56477 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf5P56477 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms