Protein–RNA interactions for Protein: P56390

Cks2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks2P56390 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cks2P56390 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cks2P56390 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cks2P56390 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms