Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab8aP55258 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab8aP55258 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms