Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sh3bp1P55194 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms