Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pex2P55098 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pex2P55098 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pex2P55098 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pex2P55098 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pex2P55098 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pex2P55098 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pex2P55098 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms