Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acod1P54987 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Acod1P54987 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acod1P54987 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acod1P54987 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acod1P54987 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms