Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ephb4P54761 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ephb4P54761 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ephb4P54761 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ephb4P54761 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms