Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rad23bP54728 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms