Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RabggtbP53612 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtbP53612 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtbP53612 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms