Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DbtP53395 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DbtP53395 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DbtP53395 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DbtP53395 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DbtP53395 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DbtP53395 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DbtP53395 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DbtP53395 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DbtP53395 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DbtP53395 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DbtP53395 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DbtP53395 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DbtP53395 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DbtP53395 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DbtP53395 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DbtP53395 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbtP53395 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbtP53395 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbtP53395 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbtP53395 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbtP53395 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbtP53395 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbtP53395 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbtP53395 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbtP53395 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DbtP53395 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbtP53395 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbtP53395 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbtP53395 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbtP53395 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbtP53395 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbtP53395 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbtP53395 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbtP53395 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbtP53395 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbtP53395 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbtP53395 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbtP53395 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbtP53395 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbtP53395 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbtP53395 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DbtP53395 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbtP53395 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbtP53395 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbtP53395 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbtP53395 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbtP53395 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms