Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClgnP52194 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ClgnP52194 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClgnP52194 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ClgnP52194 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms