Protein–RNA interactions for Protein: P51859

Hdgf, Hepatoma-derived growth factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdgfP51859 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HdgfP51859 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HdgfP51859 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdgfP51859 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdgfP51859 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HdgfP51859 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HdgfP51859 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HdgfP51859 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdgfP51859 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HdgfP51859 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms