Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CntfP51642 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CntfP51642 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CntfP51642 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfP51642 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfP51642 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfP51642 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfP51642 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfP51642 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfP51642 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfP51642 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfP51642 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfP51642 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CntfP51642 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfP51642 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfP51642 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfP51642 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfP51642 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfP51642 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfP51642 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfP51642 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfP51642 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfP51642 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfP51642 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfP51642 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CntfP51642 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfP51642 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfP51642 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfP51642 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfP51642 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfP51642 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfP51642 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfP51642 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfP51642 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfP51642 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfP51642 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfP51642 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CntfP51642 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfP51642 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfP51642 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfP51642 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfP51642 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfP51642 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfP51642 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfP51642 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfP51642 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfP51642 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfP51642 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfP51642 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CntfP51642 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CntfP51642 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CntfP51642 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CntfP51642 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CntfP51642 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CntfP51642 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CntfP51642 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CntfP51642 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfP51642 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfP51642 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfP51642 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfP51642 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfP51642 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfP51642 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfP51642 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfP51642 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfP51642 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CntfP51642 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms