Protein–RNA interactions for Protein: P50715

Defa-rs7, Alpha-defensin-related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs7P50715 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa-rs7P50715 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs7P50715 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms