Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanccP50652 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanccP50652 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanccP50652 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanccP50652 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanccP50652 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanccP50652 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanccP50652 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanccP50652 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FanccP50652 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanccP50652 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FanccP50652 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanccP50652 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanccP50652 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanccP50652 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanccP50652 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanccP50652 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanccP50652 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanccP50652 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanccP50652 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanccP50652 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanccP50652 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FanccP50652 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FanccP50652 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanccP50652 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanccP50652 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanccP50652 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanccP50652 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanccP50652 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanccP50652 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanccP50652 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FanccP50652 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FanccP50652 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FanccP50652 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FanccP50652 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FanccP50652 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FanccP50652 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FanccP50652 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FanccP50652 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FanccP50652 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FanccP50652 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FanccP50652 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FanccP50652 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FanccP50652 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FanccP50652 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FanccP50652 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms