Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TspoP50637 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TspoP50637 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TspoP50637 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TspoP50637 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TspoP50637 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TspoP50637 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TspoP50637 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TspoP50637 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TspoP50637 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TspoP50637 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TspoP50637 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TspoP50637 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TspoP50637 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TspoP50637 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms