Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SftpdP50404 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SftpdP50404 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SftpdP50404 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SftpdP50404 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SftpdP50404 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SftpdP50404 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SftpdP50404 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SftpdP50404 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SftpdP50404 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms