Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LtbrP50284 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LtbrP50284 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LtbrP50284 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LtbrP50284 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LtbrP50284 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LtbrP50284 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LtbrP50284 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LtbrP50284 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LtbrP50284 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LtbrP50284 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms