Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcl5P50228 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cxcl5P50228 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl5P50228 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl5P50228 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl5P50228 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl5P50228 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms