Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-1P50220 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms