Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BckdhaP50136 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BckdhaP50136 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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