Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtshP49935 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtshP49935 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtshP49935 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtshP49935 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtshP49935 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CtshP49935 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtshP49935 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtshP49935 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtshP49935 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CtshP49935 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CtshP49935 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtshP49935 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtshP49935 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtshP49935 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtshP49935 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtshP49935 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtshP49935 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtshP49935 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtshP49935 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CtshP49935 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtshP49935 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtshP49935 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtshP49935 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtshP49935 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtshP49935 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtshP49935 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtshP49935 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtshP49935 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtshP49935 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtshP49935 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtshP49935 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtshP49935 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtshP49935 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtshP49935 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtshP49935 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtshP49935 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtshP49935 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtshP49935 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtshP49935 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtshP49935 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CtshP49935 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtshP49935 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtshP49935 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtshP49935 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtshP49935 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtshP49935 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtshP49935 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtshP49935 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtshP49935 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtshP49935 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtshP49935 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtshP49935 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtshP49935 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CtshP49935 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CtshP49935 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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