Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hcls1P49710 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hcls1P49710 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms