Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpreP49446 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpreP49446 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpreP49446 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpreP49446 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpreP49446 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpreP49446 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpreP49446 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpreP49446 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpreP49446 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpreP49446 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpreP49446 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpreP49446 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtpreP49446 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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