Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ercc3P49135 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ercc3P49135 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ercc3P49135 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms