Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbx2P48031 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms