Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TgfaP48030 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TgfaP48030 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TgfaP48030 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TgfaP48030 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TgfaP48030 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TgfaP48030 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TgfaP48030 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TgfaP48030 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TgfaP48030 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TgfaP48030 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TgfaP48030 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TgfaP48030 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TgfaP48030 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TgfaP48030 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TgfaP48030 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TgfaP48030 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TgfaP48030 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms