Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf1P46099 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf1P46099 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf1P46099 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf1P46099 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf1P46099 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf1P46099 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf1P46099 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms