Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr3P43300 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr3P43300 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Egr3P43300 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms