Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Mmp9P41245 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Mmp9P41245 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp9P41245 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Mmp9P41245 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp9P41245 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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