Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ThpoP40226 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ThpoP40226 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ThpoP40226 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ThpoP40226 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ThpoP40226 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms