Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp3P39876 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp3P39876 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp3P39876 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timp3P39876 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timp3P39876 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Timp3P39876 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms