Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf1P39428 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Traf1P39428 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Traf1P39428 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf1P39428 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf1P39428 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf1P39428 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf1P39428 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf1P39428 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf1P39428 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms