Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upk2P38575 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upk2P38575 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upk2P38575 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upk2P38575 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Upk2P38575 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms