Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpargP37238 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpargP37238 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpargP37238 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpargP37238 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PpargP37238 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpargP37238 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpargP37238 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpargP37238 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpargP37238 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpargP37238 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpargP37238 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpargP37238 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PpargP37238 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PpargP37238 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpargP37238 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpargP37238 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpargP37238 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpargP37238 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpargP37238 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpargP37238 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PpargP37238 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PpargP37238 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PpargP37238 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PpargP37238 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PpargP37238 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PpargP37238 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PpargP37238 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PpargP37238 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PpargP37238 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpargP37238 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpargP37238 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpargP37238 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpargP37238 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpargP37238 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpargP37238 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpargP37238 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpargP37238 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpargP37238 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpargP37238 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpargP37238 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpargP37238 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpargP37238 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms